上海市第六人民医院金山分院病理科，建立于1976年1月，建立之初是上海市金山区所属的医院中唯一的病理科，除承担上海市第六人民医院金山分院/上海市金山区中心医院工作外 还承担金山区内各医院的病理检查诊断工作。经过40余年的发展和建设，目前病理科已发展成为具有一定规模和水平的病理专业科室。现在每年开展常规病理检查13000多例，术中快速冰冻切片检查1000多例，细胞学检查16000多例，免疫组织化学2500例（15000次）。可开展免疫组化检查项目150多项，包括各种原癌基因、抑癌基因、细胞因子和受体、恶性肿瘤预后与耐药监测指标、宫颈CIN病变分级检测指标等。随着医院不断发展，病理科成为金山区北部病理诊断中心。2018年经上海市第六人民医院金山分院批准，科室被确定为院级第五周期特色专业学科。